внутри человеческого организма организованные клетки усердно трудятся, чтобы поддерживать здоровье и благополучие хозяина. однако красной кровяной клетке аа-2153 не повезло: его хозяин ведет нездоровый образ жизни, злоупотребляет алкоголем и курением, что создает благоприятные условия для размножения вирусов и бактерий. в отделе аа-2153 обеспокоены состоянием хозяина, но эритроциту некогда беспокоиться — он должен работать. в помощь ему направляют лейкоцит u-1196, способного уничтожать микробы. вместе они отправляются в очаг болезни, чтобы сразиться с многочисленными вирусами и спасти организм хозяина от гибели. аниме 'клетки за работой: тёмная сторона' расскажет о героической борьбе маленьких клеток за выживание.